MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rivularia sp. PCC 7116 plasmid pRIV7116.02

Total Repeats: 34

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019686	TTC	2	6	464	469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019686	TTG	2	6	481	486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019686	AT	3	6	499	504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019686	ATC	2	6	510	515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019686	TG	3	6	585	590	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019686	TA	3	6	593	598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019686	TAA	2	6	622	627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019686	T	7	7	781	787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019686	T	6	6	822	827	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019686	GT	3	6	845	850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019686	CAG	3	9	853	861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_019686	T	7	7	921	927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019686	ACCA	2	8	944	951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019686	TGC	2	6	988	993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019686	CGAA	2	8	1030	1037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_019686	GCA	2	6	1061	1066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019686	GGGGAA	2	12	1087	1098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019686	T	6	6	1128	1133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019686	T	7	7	1139	1145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019686	ATA	2	6	1196	1201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019686	TAT	2	6	1271	1276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019686	TTTTGG	2	12	1277	1288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019686	TTG	2	6	1301	1306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019686	TTA	2	6	1346	1351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019686	AAT	3	9	1517	1525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019686	GAC	2	6	1575	1580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019686	T	6	6	1861	1866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019686	TA	3	6	1896	1901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019686	TGA	2	6	1932	1937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019686	A	7	7	1942	1948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019686	T	6	6	2015	2020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019686	G	6	6	2031	2036	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019686	T	7	7	2044	2050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019686	ACCA	2	8	2063	2070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.